本书分为五章：第一章为食品生产经营企业食品安全自查概述，介绍了食品及食品安全的基本概念与内容；第二章为食品生产经营企业食品安全自查程序，包含食品安全自查计划、自查组织实施、自查问题整改、自查评级及报告等；第三章为食品生产经营企业食品安全自查操作指南，介绍了食品(不含特食)生产企业、食品加工小作坊、食品销售单位、特殊食品经营单位及餐饮服务单位食品安全自查内容、自查指南、风险提示及风险防控等内容；第四章为特殊食品生产经营企业食品安全自查操作指南，介绍了保健食品、婴幼儿配方乳粉、特殊医学用途配方食品生产企业食品安全自查内容、自查指南、风险提示及风险防控等内容；第五章为食品安全风险防控，介绍了食品安全风险防控的基础知识，食品生产企业、特殊食品生产企业、食品销售企业及餐饮服务企业的风险防控清单。