《生物制药工艺（第二版）》为两大模块：模块一生物制药工艺技术平台和模块二生物制药工艺综合实训操作平台。模块一由十二个项目组成，其主要内容是基本知识和基本技能，包括生物制药工艺基础知识认知、抗生素类生物技术药物的生产、氨基酸类生物技术药物的生产、多肽与蛋白质类生物技术药物的生产、酶类生物技术药物的生产、糖类生物技术药物的生产、脂类生物技术药物的生产、核酸类生物技术药物的生产、抗体生物技术药物的生产、生物制品类生物技术药物的生产，以及甾体激素类生物技术药物的生产。模块二的主要内容是综合技能实训，包括四环素的发酵生产、多粘菌素E的发酵生产、花青素的生物化学法制备、L天冬氨酸的固定化细胞法生产、基因工程α干扰素的生产和组织纤溶酶原激活剂的动物细胞工程法生产等六大项目综合实训。