《海洋行政管理》分为三部分。第一部分为理论篇，探讨海洋行政管理科学的成立及其基本学术范畴，是为全书的理论基础；第二部分为主体篇，主要探讨海洋行政管理的主体及其工作机制、海洋立法管理、海洋政策与战略等行政主体运作方面的理论问题；第三部分为对象篇，讨论实施海洋行政管理的对象及具体内容，主要介绍海洋权益管理、海洋资源管理和海洋环境管理的内容。