海洋问题是《海大日本研究》关注的重点。本期刊登了已故大庭修先生《日本江户时期画家绘制的中国帆船》、海外学者郑海麟先生《钓鱼岛与南海诸岛研究中的历史与国际法问题》、海洋安保学者小谷哲男先生《作为海洋国家的日本》、山田浩世博士《明代琉进贡使节变迁考》，以及中国海洋大学修斌、臧蕾《近年来日本海洋战略规划的制定和实施》等文章，分别论述了中日之间与海洋相关的历史、文化、战略、政策、岛屿等问题。刘江永先生的演讲也用了相当多的篇幅谈及中日钓鱼岛争端。