《中国城乡商品市场协调发展实证研究》研究的理论意义主要体现在三个方面：首先，系统探讨了商品市场对于宏观经济和微观经济主体的影响作用。尤其着重分析了商品市场对于区域经济的拉动效应以及商品市场对于城市化的影响，并分别验证了马克思的“商业的独立发展与社会生产发展成反比例”和杨格的“分工决定市场，市场决定分工”的两个假说。其次，分析了城乡商品市场发展过程中的贸易壁垒问题，利用相对价格法计算出1985--2007年中国城乡商品市场的贸易壁垒，并分析了城乡之间贸易壁垒的影响因素。最后，通过参照国内外学者有关市场化和城乡经济社会一体化的指标体系，构建了中国城乡商品市场协调发展的指标体系，并从时问维度（1978--2007年）和空间维度（30个省份）计算了城乡商品市场协调度，然后利用工具变量法分析了商品市场协调度的影响因素。