《治河通考》包括《河源考》《河决考》《议河治河考》《理河职官考》四大部分, 卷末附录了治河相关事宜, 内容涉及到政治、军事、经济、文化、自然等多个方面, 史料详实, 文献学价值较高。但是目前留存的版本有限, 只有明嘉靖十二年顾氏刻本、明嘉靖刻本。《治河通考》作为一部水利通史, 记载了自周定王至明嘉靖时期的河决信息与治河事宜, 并对历代成功治河事例进行了详细的阐述。吴山在治水过程中主张分流论, 第九卷通过汴河治水详细阐述了分流治水的科学性与合理性。