本书共设五章，第一章保护区概述，介绍了江苏省国家级水产种质资源保护区(淡水)的自然状况；第二章调查方案，介绍了调查工作内容；第三章栖息环境现状及评价，介绍了江苏省国家级水产种质资源保护区(淡水)水体理化指标、浮游植物、浮游动物及底栖动物的现状；第四章渔业资源现状及评价，介绍了江苏省国家级水产种质资源保护区(淡水)鱼类群落结构、时空分布及生物学特征等内容；第五章保护区管理政策。