本书一改过去关于医学历史类的一般叙述方式，比如编年体、断代史、纪传体等传统的叙述方式。聚焦"学科"的历时演变，从"中西"共时的镜像，结合一些里程碑式的事件或代表性方、药等，描述中国传统医学从"传统"到"现代"的动态演进及与其他医学比较研究的过程。 本书主要分为三个部分：第一部分主要从学科的概念、医学学科的概念、医学学科的方法纲要、人类文明的开化、简帛医书中体现的医学发展变化等，以大视角、大环境、大学科审视医学学科的发展变迁，描述医学学科逐步走向独立发展的过程。第二部分主要分析了"中医""西医""中药"等这几个重要的医学门类，其概念及内涵的丰富及变迁过程，特别是聚焦麻黄、金鸡纳、青蒿素、黎豆、二甲双胍等，分析了药用植物的起源及其从本草到中药学现代药物的变迁过程，从传统到现代的演进过程。第三部分主要分析了中西传统医学发展的模式和道路的异同，从"两个层面"和"三个融合"的角度，谈医学未来发展的展望，医学人文问题的思考，以及医学如何回归本原初心等。