《医学免疫学与病原生物学学习指南》的主要内容包括：、医学微生物概述、细菌的形态与结构、细菌的生理与遗传变异、细菌与外界环境、细菌的致病性、医学免疫学概述、免疫系统、抗原、免疫球蛋白、补体系统、免疫应答、抗感染免疫、超敏反应、自身免疫性疾病与免疫缺陷病、肿瘤免疫与移植免疫、免疫学应用、病原性细菌、化脓性细菌、肠道感染细菌、厌氧性细菌、呼吸道感染细菌、动物源性细菌等等。