本书的研究内容主要包括三个方面：一是跨域合作治理中府际关系的理论构建，运用制度性集体行动框架和交易成本理论，构建了一个跨域合作治理机制选择的理论分析框架，以此来分析制约政府纵向协作和横向协作之间关系的影响因素。二是对我国跨域合作治理中的府际关系进行分析，指出了我国当前跨域合作治理机制的特征及趋势，从三个层面对我国跨域合作治理机制中的府际关系进行剖析，提出了纵向嵌入式机制的概念，并结合我国府际关系的特征，构建了纵向嵌入式治理机制选择的分析框架。三是从城市群治理、流域生态补偿、流域水资源综合治理、区域大气污染治理等方面对我国跨域合作治理中的府际关系进行了实证研究。