政治学乃至整个社会科学中充斥着大量的“虚假的知识和错误的真理”，需要我们认真厘清。《政治学的基础理论与重大问题》从认识论上和比较历史方法论上反思中国需要什么样的政治学，提出了“走出理论实验场，建构本土政治学”的命题，以及中国政治学应该遵循的“语境—议程—方法”研究方法，对流行中的制度主义理论进行中国语境下的理解和建构。对政治学的基础理论和根本问题，如国家、民主以及国际冲突，《政治学的基础理论与重大问题》也多有反思性的重新解读。