《免疫微生态学》分四篇共30章：第一篇包括8章，系总论部分，介绍免疫微生态学概念的形成及其发展背景，正常微生物的组成、生理功能，机体免疫系统概述，微生态平衡及失衡状态对机体免疫功能的影响，肠漏的概念及与机体免疫系统活化的关系，微生物的检测和培养方法，基因测序技术和生物信息分析在微生态研究中的应用，以及免疫微生态的信息化系统；第二篇为各系统免疫微生态各论，包括11章，根据现有资料，叙述各系统免疫微生态特征及临床诊疗策略；第三篇为风湿性疾病免疫微生态各论，包括7章，阐述了各类风湿性疾病的免疫微生态特征及临床诊疗策略；第四篇包括4章，详细介绍了微生态调节剂的种类、功能及临床应用。